陕西省秦岭北麓地区人民检察院（西安铁路运输检察院）是于1980年开始筹建，1982年5月1日正式挂牌办案。原属全国铁路运输检察院西安分院领导，1984年西安铁路局撤销后并入郑州铁路局，西安铁路运输检察院随之划归河南省人民检察院郑州铁路运输分院领导。1986年宝鸡铁路分局撤销，宝鸡铁路运输检察院缩编，改制为宝鸡检察室（办理综合业务），并入西安铁路运输检察院。随着铁路生产力布局调整，2005年3月18日恢复西安铁路局（现更名为中国铁路西安局集团有限公司）后，2006年9月，经最高人民检察院批准，成立了陕西省人民检察院西安铁路运输分院，西安铁路运输检察院接受其领导。按照中央关于改革铁路公检法管理体制的精神和《关于我省铁路两级检察院机构设置问题的通知》规定，西安铁路运输检察院于2012年7月份移交陕西省人民检察院属地管理，正式纳入国家司法管理体系。2022年7月28日，根据《中华人民共和国人民检察院组织法》有关规定，陕西省第十三届人民代表大会常务委员会第35次会议决定批准设立陕西省秦岭北麓地区人民检察院，与西安铁路运输检察院实行一个机构、两块牌子。